Tính đến tháng 8 năm 2011[cập nhật], SpaceX sản xuất tám động cơ Merlin mỗi tháng, với kế hoạch nâng sản lượng lên khoảng 33 động cơ mỗi tháng (hoặc 400 động cơ mỗi năm).[48] Đến tháng 9 năm 2013, tổng không gian sản xuất của SpaceX đã tăng lên gần 1 triệu foot vuông (93.000 mét vuông). Nhà máy đã được cấu hình để đạt được tốc độ sản xuất tối đa lên tới 40 tên lửa mỗi năm với nhu cầu 400 động cơ hàng năm.[49] Đến tháng 10 năm 2014, SpaceX thông báo rằng họ đã sản xuất động cơ Merlin 1D thứ 100 và các động cơ hiện đang được sản xuất với tốc độ 4 chiếc mỗi tuần, sắp tới sẽ tăng lên 5 chiếc mỗi tuần.[50][51]

Vào tháng 2 năm 2016, SpaceX nói rằng công ty sẽ cần chế tạo hàng trăm động cơ mỗi năm để đáp ứng kế hoạch chế tạo 30 tên lửa Falcon 9/Falcon Heavy hàng năm vào cuối năm 2016. [52]

Mỗi tên lửa Falcon 9 sử dụng chín động cơ Merlin, và giai đoạn thứ hai của tên lửa sử dụng một động cơ Merlin Vacuum. Giai đoạn thứ hai của tên lửa không được tái sử dụng, vì vậy mỗi lần phóng tiêu thụ một động cơ Merlin Vacuum. SpaceX đã thiết kế tên lửa với khả năng thu hồi động cơ khi hạ cánh, và tên lửa được thu hồi đầu tiên được tái sử dụng vào tháng 3 năm 2017. Đến năm 2020, chỉ có 5 trong số 26 lần phóng Falcon 9 sử dụng tên lửa đẩy mới. 26 lần phóng này sử dụng 26 động cơ Merlin Vacuum mới và 45 động cơ Merlin được tái sử dụng. Trong 10 tháng đầu năm 2021, đã có 24 lần phóng Falcon 9, một trong số đó sử dụng động cơ mới.